2011年4月24日，清华大学百年校庆庆祝大会在北京人民大会堂举行，党和国家领导人胡锦涛、吴邦国、温家宝、贾庆林、习近平、李克强等出席了大会，胡锦涛总书记发表了重要讲话。受邀出席的有中央和国家机关有关部门的负责同志、国内外著名大学校长、全国优秀高中校长和清华校友代表、师生代表共8000多人。

24日上午10时，王佩东校长在人民大会堂参加了清华大学百年校庆庆祝大会，聆听了胡锦涛总书记的讲话；中午，在人民大会堂二层宴会厅参加了清华大学组织的国宴。

25日，在由清华大学、中国高等教育学会、中国教育学会、中央教科所等联合举办的“全国优秀高中与高校衔接培养拔尖创新人才论坛”上，来自全国各省市、港澳地区、马来西亚、韩国等地的名校校长，就人才培养体制改革、创新人才培养模式、创新人才选拔机制、创新教育教学方法和人才评价制度等进行探索和研究。论坛中全国及海外著名中学校长之间对话，加深各著名中学的交流与合作共同探讨教育教学改革，做好名牌中学与著名大学之间的衔接。交大附中作为受邀单位参加了论坛交流。

作为清华大学优秀生源基地，多年来，西安交大附中向清华大学输送了大批优秀毕业生，受到了清华大学的格外青睐。据悉，清华大学百年校庆活动共邀请了中外300名优秀中学校长参加，王佩东校长是陕西省受邀请的八位校长之一。